태아기에 중요하게 다루어 주어야 할 또 하나의 문제는 바로 약물사용이다. 흡연이나 음주 또는 불법약물사용은 태아에게 심각한 영향을 준다. 이러한 약물을 사용하는 산모는 별로 해롭지 않을 거라고 부정하거나 저항을 보일 수도 있다. 그러한 약물사용을 중단할 수 있도록 도와주어야 한다. 산모가 다른 질병을 가지고 있어 어절 수 없이 약을 복용해야 하는 경우에도 태아에게 영향을 덜 줄 수 있는 약을 복용하도록 신중히 고려해야 한다. 임신초기에는 감기약이나 카페인 성분 음료도 주의해서 복용해야 한다.