주된 문제가 확인되면 목표를 설정한다. 목표설정은 내담자가 상담을 통해 도달하고 싶은 결과를 나타내는 것으로 치료적 과정의 방향을 제시해 주고, 목표는 가족이 달성하기를 원하는 것을 확인하는 것이며, 상담에 동기적 기능, 교육적 기능 및 평가적 기능을 부여해 준다. 즉 상담기간 동안 상담자는 내담자가 새로운 반응을 형성해 줄 수 있도록 도와준다. 그러나 가족과 상담자가 문제의 상황에 대해서 충분하게 이해하기 전까지는 목표를 설정하는 것은 시기상조이다.