사회병리론은 여타 이론과 같이 상대적이면서 나름대로 한계를 지니고 있다. 사회병리론의 한계점은 크게 세 가지이다.
첫째, 완벽하게 건강하고 정상적인 사회가 현실적으로 존재하기 어렵다는 점이다. 사회병리론은 생물체에 적용되는 원리와 이론을 인간사회에 유추하여 적용하였다. 이는 기능주의 이론에 일반적으로 적용되는 내용이므로 비단 사회병리론에만 한계점으로 작용하는 것은 아닐 것이다.
생물체는 총체적으로 완벽하게 기능할 때에 정상이고 건강하다고 할 수 있다. 이를 사회에 유추하면 사회구성원이 모두 완벽하게 스스로의 역할과 기