갯벌은 희귀 철새를 포함한 다양한 생물들의 서식지가 되고, 수산물의 생산지이며, 육지로부터 흘러 들어오는 오염물질을 정화하는 능력을 갖고 있을 뿐 아니라 아름다운 경치와 심미적 가치를 제공하여 왔다. 그러나 갯벌의 간척․매립은 이러한 갯벌의 기능들을 사라지게 하고 있다. 갯벌을 매립함으로 인하여 갯벌생물의 서식처가 사라지게 되고, 각종 해양생물들의 생존에 악영향을 주게 되어 수산물의 감소를 가져오고 있다. 또한 정화기능의 상실로 인하여 주변 바다의 부영양화와 유기물오염이 심화되며, 갯벌 인근 주민들의 전통적인 반농반어(半農半漁) 생계방식의 변화와 지역사회 파괴, 미래세대가 누려야 할 자원의 훼손 등 많은 문제점이 나타나고 있다.
2. 연안생태계 파괴
생태계에서 종다양성이란 그 군집의 성숙도와 안정성을 나타내는 지표로서 군집의 천이과정을 나타내거나, 다른 군집과의 비교를 위해 사용되는데, 시화호 주변 해양생태계의 경우 군집의 종수가 크게 줄어들고, 오염지시생물종의 폭발적인 증가로 매우 낮은 종 다양성 지수를 나타냈다.또한, 인천 송도 신도시 매립지 등 해안매립지 인근 갯벌에 사는 저서생물 등이 급감했다는 보고도 있다.이 연구에 의하면 1995년 2월부터 1997년 11월까지 12차례에 걸쳐 준설매립지인 송도신도시 매립지와 인천 LNG 인수기지에 인접한 주변해역 3개 지점에서 저서생물의 출현종수가 최고 40% 정도 줄어든 것으로 나타났다.
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